Пациента кладут на подвижную часть томографа – так называемый стол. На теле закрепляют специальную катушку – принимающее сигнал устройство. После этого подвижная часть медленно перемещается в туннель аппарата. Специалист, который проводит исследование, находится при этом в другой комнате за компьютером. Он наблюдает за пациентом через специальное окно и общается с ним по громкой связи. Если необходимо, пациент должен на время задерживать дыхание.

В некоторых случаях проводят МСКТ с применением контрастных препаратов. Это специальные вещества, позволяющие улучшить четкость изображаемого объекта на снимках. Они вводятся в вену пациенту непосредственно перед началом процедуры. Обычно лекарства хорошо переносятся и не вызывают аллергических реакций. Однако если пациент ранее уже страдал от аллергии, ему следует обязательно предупредить об этом врача.